Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM3P25205 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM3P25205 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM3P25205 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM3P25205 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM3P25205 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM3P25205 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCM3P25205 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCM3P25205 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCM3P25205 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCM3P25205 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCM3P25205 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3P25205 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3P25205 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3P25205 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3P25205 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3P25205 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3P25205 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3P25205 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3P25205 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3P25205 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3P25205 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3P25205 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3P25205 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3P25205 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3P25205 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3P25205 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3P25205 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3P25205 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3P25205 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3P25205 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3P25205 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3P25205 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms