Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms