Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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