Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP100P23497 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP100P23497 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SP100P23497 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP100P23497 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP100P23497 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP100P23497 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP100P23497 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP100P23497 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP100P23497 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP100P23497 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP100P23497 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP100P23497 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP100P23497 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP100P23497 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP100P23497 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP100P23497 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP100P23497 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP100P23497 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP100P23497 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP100P23497 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP100P23497 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP100P23497 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP100P23497 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP100P23497 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP100P23497 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP100P23497 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP100P23497 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP100P23497 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP100P23497 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP100P23497 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP100P23497 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP100P23497 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP100P23497 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP100P23497 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP100P23497 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP100P23497 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP100P23497 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SP100P23497 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP100P23497 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP100P23497 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP100P23497 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SP100P23497 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP100P23497 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP100P23497 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP100P23497 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP100P23497 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP100P23497 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP100P23497 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP100P23497 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP100P23497 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SP100P23497 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP100P23497 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP100P23497 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SP100P23497 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP100P23497 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms