Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACO1P21399 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACO1P21399 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACO1P21399 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACO1P21399 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACO1P21399 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACO1P21399 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACO1P21399 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACO1P21399 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACO1P21399 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACO1P21399 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACO1P21399 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACO1P21399 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACO1P21399 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACO1P21399 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACO1P21399 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACO1P21399 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACO1P21399 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACO1P21399 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACO1P21399 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACO1P21399 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACO1P21399 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACO1P21399 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACO1P21399 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACO1P21399 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACO1P21399 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACO1P21399 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACO1P21399 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACO1P21399 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACO1P21399 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACO1P21399 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACO1P21399 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACO1P21399 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACO1P21399 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACO1P21399 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACO1P21399 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACO1P21399 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACO1P21399 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACO1P21399 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACO1P21399 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACO1P21399 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACO1P21399 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACO1P21399 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACO1P21399 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACO1P21399 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACO1P21399 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACO1P21399 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACO1P21399 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACO1P21399 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACO1P21399 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACO1P21399 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACO1P21399 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACO1P21399 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACO1P21399 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACO1P21399 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACO1P21399 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACO1P21399 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACO1P21399 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACO1P21399 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACO1P21399 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACO1P21399 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACO1P21399 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACO1P21399 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACO1P21399 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACO1P21399 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACO1P21399 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACO1P21399 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms