Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF4P18085 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF4P18085 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF4P18085 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF4P18085 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF4P18085 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF4P18085 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF4P18085 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF4P18085 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF4P18085 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF4P18085 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF4P18085 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF4P18085 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF4P18085 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF4P18085 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF4P18085 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF4P18085 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF4P18085 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF4P18085 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF4P18085 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF4P18085 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARF4P18085 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARF4P18085 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF4P18085 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF4P18085 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF4P18085 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF4P18085 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF4P18085 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF4P18085 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF4P18085 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF4P18085 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF4P18085 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms