Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms