Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA1P17302 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA1P17302 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJA1P17302 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA1P17302 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA1P17302 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA1P17302 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA1P17302 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA1P17302 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA1P17302 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA1P17302 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA1P17302 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA1P17302 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA1P17302 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA1P17302 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA1P17302 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA1P17302 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA1P17302 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA1P17302 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA1P17302 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA1P17302 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA1P17302 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA1P17302 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA1P17302 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA1P17302 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA1P17302 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA1P17302 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA1P17302 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA1P17302 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA1P17302 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA1P17302 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA1P17302 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA1P17302 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA1P17302 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA1P17302 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA1P17302 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA1P17302 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA1P17302 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA1P17302 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA1P17302 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA1P17302 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA1P17302 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA1P17302 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA1P17302 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA1P17302 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA1P17302 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA1P17302 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA1P17302 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA1P17302 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA1P17302 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA1P17302 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA1P17302 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA1P17302 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA1P17302 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA1P17302 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA1P17302 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA1P17302 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA1P17302 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA1P17302 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA1P17302 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA1P17302 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA1P17302 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA1P17302 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms