Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL7RP16871 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL7RP16871 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL7RP16871 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL7RP16871 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL7RP16871 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL7RP16871 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL7RP16871 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL7RP16871 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL7RP16871 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL7RP16871 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL7RP16871 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL7RP16871 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL7RP16871 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IL7RP16871 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL7RP16871 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL7RP16871 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL7RP16871 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL7RP16871 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms