Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A2P16615 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms