Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB1P16220 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB1P16220 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB1P16220 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB1P16220 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB1P16220 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB1P16220 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB1P16220 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB1P16220 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB1P16220 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB1P16220 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB1P16220 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB1P16220 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB1P16220 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB1P16220 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB1P16220 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB1P16220 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB1P16220 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB1P16220 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB1P16220 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB1P16220 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB1P16220 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB1P16220 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB1P16220 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB1P16220 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB1P16220 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB1P16220 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB1P16220 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB1P16220 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB1P16220 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB1P16220 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB1P16220 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB1P16220 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB1P16220 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB1P16220 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB1P16220 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB1P16220 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB1P16220 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB1P16220 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB1P16220 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB1P16220 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB1P16220 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB1P16220 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB1P16220 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB1P16220 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB1P16220 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB1P16220 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB1P16220 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB1P16220 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB1P16220 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB1P16220 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB1P16220 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB1P16220 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB1P16220 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB1P16220 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB1P16220 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB1P16220 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB1P16220 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB1P16220 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB1P16220 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB1P16220 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB1P16220 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB1P16220 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB1P16220 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB1P16220 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB1P16220 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB1P16220 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB1P16220 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB1P16220 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB1P16220 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CREB1P16220 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CREB1P16220 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CREB1P16220 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB1P16220 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB1P16220 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB1P16220 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB1P16220 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB1P16220 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB1P16220 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB1P16220 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB1P16220 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB1P16220 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms