Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
DSPP15924 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
DSPP15924 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
DSPP15924 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSPP15924 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSPP15924 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSPP15924 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSPP15924 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSPP15924 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DSPP15924 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSPP15924 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSPP15924 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSPP15924 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSPP15924 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSPP15924 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSPP15924 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSPP15924 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSPP15924 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSPP15924 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSPP15924 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSPP15924 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSPP15924 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DSPP15924 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSPP15924 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DSPP15924 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSPP15924 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSPP15924 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSPP15924 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSPP15924 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSPP15924 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSPP15924 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSPP15924 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSPP15924 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSPP15924 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSPP15924 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSPP15924 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSPP15924 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSPP15924 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DSPP15924 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSPP15924 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSPP15924 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSPP15924 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSPP15924 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSPP15924 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DSPP15924 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms