Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFP11831 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFP11831 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFP11831 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFP11831 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFP11831 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFP11831 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFP11831 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFP11831 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFP11831 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRFP11831 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRFP11831 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRFP11831 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRFP11831 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRFP11831 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRFP11831 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRFP11831 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRFP11831 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRFP11831 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRFP11831 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRFP11831 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRFP11831 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRFP11831 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRFP11831 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRFP11831 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRFP11831 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms