Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms