Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD28P10747 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD28P10747 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD28P10747 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CD28P10747 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD28P10747 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms