Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms