Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms