Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2BP0C7M4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms