Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CT47B1P0C2W7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms