Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM2P07951 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM2P07951 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM2P07951 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM2P07951 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM2P07951 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM2P07951 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM2P07951 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM2P07951 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM2P07951 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM2P07951 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM2P07951 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM2P07951 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM2P07951 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM2P07951 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM2P07951 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM2P07951 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM2P07951 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM2P07951 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM2P07951 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM2P07951 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM2P07951 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM2P07951 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM2P07951 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM2P07951 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM2P07951 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM2P07951 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM2P07951 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM2P07951 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM2P07951 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM2P07951 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM2P07951 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPM2P07951 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPM2P07951 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPM2P07951 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM2P07951 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM2P07951 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM2P07951 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM2P07951 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM2P07951 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM2P07951 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM2P07951 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM2P07951 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM2P07951 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM2P07951 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM2P07951 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM2P07951 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM2P07951 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM2P07951 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM2P07951 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM2P07951 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM2P07951 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM2P07951 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM2P07951 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM2P07951 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM2P07951 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM2P07951 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM2P07951 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM2P07951 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM2P07951 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM2P07951 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM2P07951 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM2P07951 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM2P07951 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM2P07951 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM2P07951 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM2P07951 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM2P07951 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM2P07951 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM2P07951 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM2P07951 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM2P07951 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM2P07951 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM2P07951 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms