Protein–RNA interactions for Protein: P07205

PGK2, Phosphoglycerate kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGK2P07205 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGK2P07205 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGK2P07205 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGK2P07205 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGK2P07205 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGK2P07205 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PGK2P07205 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGK2P07205 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGK2P07205 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGK2P07205 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGK2P07205 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGK2P07205 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGK2P07205 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGK2P07205 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PGK2P07205 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGK2P07205 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGK2P07205 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGK2P07205 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGK2P07205 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGK2P07205 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGK2P07205 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGK2P07205 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGK2P07205 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGK2P07205 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGK2P07205 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PGK2P07205 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGK2P07205 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGK2P07205 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGK2P07205 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGK2P07205 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGK2P07205 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGK2P07205 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGK2P07205 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGK2P07205 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGK2P07205 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGK2P07205 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGK2P07205 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGK2P07205 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGK2P07205 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGK2P07205 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGK2P07205 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGK2P07205 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGK2P07205 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGK2P07205 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGK2P07205 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGK2P07205 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGK2P07205 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGK2P07205 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGK2P07205 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGK2P07205 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGK2P07205 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PGK2P07205 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGK2P07205 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGK2P07205 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGK2P07205 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGK2P07205 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGK2P07205 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGK2P07205 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGK2P07205 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PGK2P07205 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGK2P07205 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGK2P07205 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGK2P07205 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGK2P07205 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGK2P07205 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGK2P07205 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGK2P07205 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGK2P07205 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms