Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYBBP04839 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYBBP04839 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYBBP04839 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYBBP04839 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYBBP04839 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYBBP04839 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYBBP04839 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYBBP04839 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYBBP04839 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYBBP04839 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYBBP04839 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYBBP04839 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYBBP04839 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYBBP04839 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYBBP04839 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYBBP04839 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYBBP04839 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYBBP04839 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYBBP04839 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYBBP04839 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYBBP04839 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYBBP04839 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYBBP04839 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYBBP04839 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYBBP04839 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYBBP04839 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYBBP04839 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYBBP04839 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYBBP04839 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYBBP04839 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYBBP04839 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYBBP04839 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYBBP04839 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYBBP04839 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYBBP04839 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYBBP04839 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYBBP04839 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYBBP04839 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYBBP04839 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYBBP04839 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYBBP04839 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYBBP04839 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYBBP04839 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYBBP04839 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYBBP04839 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYBBP04839 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYBBP04839 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYBBP04839 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms