Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYMSP04818 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYMSP04818 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYMSP04818 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYMSP04818 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYMSP04818 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYMSP04818 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYMSP04818 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYMSP04818 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYMSP04818 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYMSP04818 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYMSP04818 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYMSP04818 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYMSP04818 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYMSP04818 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYMSP04818 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYMSP04818 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYMSP04818 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYMSP04818 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TYMSP04818 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TYMSP04818 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TYMSP04818 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TYMSP04818 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TYMSP04818 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TYMSP04818 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TYMSP04818 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TYMSP04818 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TYMSP04818 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TYMSP04818 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TYMSP04818 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TYMSP04818 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TYMSP04818 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TYMSP04818 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms