Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
A1BGP04217 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A1BGP04217 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A1BGP04217 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A1BGP04217 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
A1BGP04217 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A1BGP04217 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A1BGP04217 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A1BGP04217 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
A1BGP04217 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A1BGP04217 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A1BGP04217 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A1BGP04217 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A1BGP04217 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A1BGP04217 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
A1BGP04217 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A1BGP04217 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
A1BGP04217 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
A1BGP04217 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A1BGP04217 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A1BGP04217 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1BGP04217 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A1BGP04217 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A1BGP04217 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A1BGP04217 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A1BGP04217 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A1BGP04217 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
A1BGP04217 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
A1BGP04217 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A1BGP04217 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
A1BGP04217 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A1BGP04217 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A1BGP04217 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A1BGP04217 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A1BGP04217 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A1BGP04217 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A1BGP04217 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A1BGP04217 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
A1BGP04217 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
A1BGP04217 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
A1BGP04217 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A1BGP04217 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1BGP04217 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1BGP04217 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1BGP04217 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1BGP04217 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1BGP04217 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1BGP04217 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1BGP04217 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1BGP04217 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1BGP04217 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1BGP04217 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1BGP04217 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1BGP04217 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1BGP04217 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A1BGP04217 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A1BGP04217 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A1BGP04217 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A1BGP04217 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A1BGP04217 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A1BGP04217 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A1BGP04217 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A1BGP04217 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1BGP04217 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1BGP04217 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1BGP04217 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1BGP04217 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1BGP04217 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1BGP04217 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1BGP04217 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1BGP04217 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1BGP04217 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A1BGP04217 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms