Protein–RNA interactions for Protein: P00352

ALDH1A1, Retinal dehydrogenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A1P00352 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A1P00352 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A1P00352 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALDH1A1P00352 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A1P00352 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A1P00352 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A1P00352 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A1P00352 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A1P00352 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms