Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP4O95707 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP4O95707 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP4O95707 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP4O95707 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP4O95707 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POP4O95707 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP4O95707 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP4O95707 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP4O95707 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP4O95707 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP4O95707 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP4O95707 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP4O95707 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POP4O95707 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP4O95707 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP4O95707 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP4O95707 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POP4O95707 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP4O95707 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP4O95707 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP4O95707 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP4O95707 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP4O95707 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP4O95707 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP4O95707 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP4O95707 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP4O95707 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP4O95707 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP4O95707 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP4O95707 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP4O95707 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POP4O95707 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP4O95707 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP4O95707 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP4O95707 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP4O95707 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP4O95707 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP4O95707 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP4O95707 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP4O95707 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP4O95707 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP4O95707 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms