Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms