Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC2O95347 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC2O95347 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC2O95347 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC2O95347 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC2O95347 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC2O95347 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC2O95347 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC2O95347 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC2O95347 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC2O95347 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC2O95347 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC2O95347 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC2O95347 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC2O95347 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC2O95347 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC2O95347 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC2O95347 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC2O95347 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC2O95347 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC2O95347 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC2O95347 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC2O95347 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC2O95347 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC2O95347 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC2O95347 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC2O95347 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC2O95347 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC2O95347 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC2O95347 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC2O95347 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC2O95347 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC2O95347 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC2O95347 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC2O95347 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC2O95347 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC2O95347 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC2O95347 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC2O95347 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC2O95347 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC2O95347 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC2O95347 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC2O95347 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC2O95347 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC2O95347 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC2O95347 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC2O95347 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC2O95347 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC2O95347 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC2O95347 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC2O95347 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC2O95347 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC2O95347 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC2O95347 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC2O95347 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC2O95347 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC2O95347 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMC2O95347 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMC2O95347 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMC2O95347 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC2O95347 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC2O95347 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC2O95347 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC2O95347 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC2O95347 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC2O95347 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC2O95347 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC2O95347 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC2O95347 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC2O95347 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC2O95347 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC2O95347 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC2O95347 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC2O95347 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms