Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms