Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN3O75935 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms