Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP3O75386 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP3O75386 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP3O75386 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP3O75386 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP3O75386 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP3O75386 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP3O75386 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP3O75386 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP3O75386 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP3O75386 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP3O75386 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP3O75386 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP3O75386 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP3O75386 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP3O75386 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP3O75386 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP3O75386 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP3O75386 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP3O75386 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP3O75386 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP3O75386 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TULP3O75386 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP3O75386 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP3O75386 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP3O75386 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP3O75386 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP3O75386 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP3O75386 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP3O75386 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP3O75386 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP3O75386 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP3O75386 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP3O75386 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms