Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms