Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP9AO75110 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms