Protein–RNA interactions for Protein: O60763

USO1, General vesicular transport factor p115, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USO1O60763 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USO1O60763 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USO1O60763 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USO1O60763 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USO1O60763 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USO1O60763 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USO1O60763 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USO1O60763 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USO1O60763 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USO1O60763 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USO1O60763 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USO1O60763 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USO1O60763 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USO1O60763 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USO1O60763 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USO1O60763 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USO1O60763 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USO1O60763 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USO1O60763 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USO1O60763 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USO1O60763 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USO1O60763 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USO1O60763 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USO1O60763 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USO1O60763 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USO1O60763 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USO1O60763 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USO1O60763 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USO1O60763 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USO1O60763 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USO1O60763 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USO1O60763 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USO1O60763 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USO1O60763 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USO1O60763 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USO1O60763 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USO1O60763 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USO1O60763 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USO1O60763 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USO1O60763 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USO1O60763 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USO1O60763 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USO1O60763 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USO1O60763 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USO1O60763 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms