Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNT1O60563 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms