Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SORBS3O60504 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORBS3O60504 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms