Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL4O60488 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms