Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPLO60437 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPLO60437 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPLO60437 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPLO60437 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPLO60437 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PPLO60437 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PPLO60437 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PPLO60437 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PPLO60437 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PPLO60437 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PPLO60437 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PPLO60437 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PPLO60437 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PPLO60437 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PPLO60437 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PPLO60437 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PPLO60437 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PPLO60437 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PPLO60437 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PPLO60437 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPLO60437 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPLO60437 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PPLO60437 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPLO60437 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPLO60437 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PPLO60437 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPLO60437 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPLO60437 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPLO60437 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPLO60437 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PPLO60437 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PPLO60437 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PPLO60437 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PPLO60437 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PPLO60437 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPLO60437 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PPLO60437 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PPLO60437 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PPLO60437 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PPLO60437 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PPLO60437 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PPLO60437 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PPLO60437 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPLO60437 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPLO60437 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPLO60437 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPLO60437 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPLO60437 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPLO60437 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPLO60437 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPLO60437 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPLO60437 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPLO60437 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PPLO60437 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PPLO60437 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PPLO60437 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PPLO60437 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PPLO60437 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PPLO60437 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PPLO60437 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PPLO60437 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PPLO60437 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPLO60437 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPLO60437 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PPLO60437 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPLO60437 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPLO60437 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPLO60437 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPLO60437 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPLO60437 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPLO60437 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPLO60437 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms