Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLX3O43711 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLX3O43711 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLX3O43711 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLX3O43711 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLX3O43711 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLX3O43711 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLX3O43711 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLX3O43711 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLX3O43711 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLX3O43711 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLX3O43711 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLX3O43711 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TLX3O43711 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TLX3O43711 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLX3O43711 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLX3O43711 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TLX3O43711 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TLX3O43711 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TLX3O43711 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TLX3O43711 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TLX3O43711 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TLX3O43711 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TLX3O43711 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLX3O43711 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLX3O43711 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLX3O43711 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TLX3O43711 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLX3O43711 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLX3O43711 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TLX3O43711 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLX3O43711 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLX3O43711 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLX3O43711 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLX3O43711 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLX3O43711 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLX3O43711 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLX3O43711 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLX3O43711 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLX3O43711 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLX3O43711 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLX3O43711 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLX3O43711 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLX3O43711 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLX3O43711 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLX3O43711 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLX3O43711 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLX3O43711 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLX3O43711 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLX3O43711 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLX3O43711 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLX3O43711 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLX3O43711 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLX3O43711 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLX3O43711 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLX3O43711 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TLX3O43711 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLX3O43711 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLX3O43711 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLX3O43711 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLX3O43711 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLX3O43711 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLX3O43711 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLX3O43711 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TLX3O43711 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLX3O43711 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLX3O43711 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLX3O43711 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms