Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DENRO43583 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DENRO43583 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DENRO43583 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DENRO43583 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DENRO43583 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DENRO43583 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DENRO43583 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DENRO43583 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DENRO43583 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DENRO43583 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DENRO43583 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DENRO43583 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DENRO43583 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DENRO43583 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DENRO43583 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DENRO43583 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DENRO43583 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DENRO43583 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DENRO43583 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DENRO43583 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DENRO43583 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DENRO43583 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DENRO43583 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DENRO43583 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DENRO43583 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DENRO43583 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DENRO43583 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DENRO43583 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DENRO43583 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DENRO43583 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DENRO43583 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms