Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYNJ1O43426 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms