Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATMINO43313 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMINO43313 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMINO43313 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMINO43313 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMINO43313 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMINO43313 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMINO43313 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMINO43313 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMINO43313 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMINO43313 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMINO43313 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMINO43313 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMINO43313 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMINO43313 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMINO43313 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMINO43313 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATMINO43313 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATMINO43313 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATMINO43313 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATMINO43313 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATMINO43313 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATMINO43313 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMINO43313 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMINO43313 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMINO43313 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMINO43313 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMINO43313 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMINO43313 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMINO43313 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMINO43313 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMINO43313 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMINO43313 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMINO43313 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATMINO43313 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATMINO43313 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATMINO43313 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATMINO43313 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATMINO43313 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATMINO43313 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMINO43313 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms