Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SART1O43290 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SART1O43290 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SART1O43290 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SART1O43290 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SART1O43290 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SART1O43290 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SART1O43290 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SART1O43290 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SART1O43290 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SART1O43290 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SART1O43290 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SART1O43290 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SART1O43290 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SART1O43290 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SART1O43290 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SART1O43290 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SART1O43290 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SART1O43290 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SART1O43290 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SART1O43290 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SART1O43290 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SART1O43290 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SART1O43290 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SART1O43290 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SART1O43290 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SART1O43290 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SART1O43290 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SART1O43290 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SART1O43290 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SART1O43290 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SART1O43290 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SART1O43290 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SART1O43290 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SART1O43290 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SART1O43290 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SART1O43290 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SART1O43290 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SART1O43290 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SART1O43290 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SART1O43290 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SART1O43290 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SART1O43290 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SART1O43290 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SART1O43290 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SART1O43290 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SART1O43290 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SART1O43290 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SART1O43290 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SART1O43290 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SART1O43290 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SART1O43290 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SART1O43290 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SART1O43290 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SART1O43290 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SART1O43290 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SART1O43290 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms