Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEFVO15553 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEFVO15553 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEFVO15553 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEFVO15553 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEFVO15553 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEFVO15553 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEFVO15553 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MEFVO15553 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEFVO15553 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEFVO15553 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEFVO15553 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEFVO15553 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEFVO15553 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MEFVO15553 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEFVO15553 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEFVO15553 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEFVO15553 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEFVO15553 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MEFVO15553 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEFVO15553 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEFVO15553 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEFVO15553 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEFVO15553 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEFVO15553 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEFVO15553 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEFVO15553 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEFVO15553 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEFVO15553 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEFVO15553 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEFVO15553 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEFVO15553 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEFVO15553 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEFVO15553 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEFVO15553 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MEFVO15553 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEFVO15553 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEFVO15553 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEFVO15553 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEFVO15553 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEFVO15553 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MEFVO15553 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEFVO15553 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEFVO15553 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEFVO15553 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEFVO15553 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEFVO15553 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEFVO15553 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEFVO15553 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEFVO15553 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEFVO15553 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEFVO15553 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms