Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLOCKO15516 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms