Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
ABCC4O15439 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ABCC4O15439 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ABCC4O15439 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC4O15439 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC4O15439 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC4O15439 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC4O15439 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC4O15439 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC4O15439 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC4O15439 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC4O15439 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCC4O15439 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC4O15439 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC4O15439 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC4O15439 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC4O15439 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC4O15439 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC4O15439 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC4O15439 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC4O15439 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC4O15439 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC4O15439 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC4O15439 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC4O15439 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC4O15439 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC4O15439 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC4O15439 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC4O15439 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC4O15439 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC4O15439 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC4O15439 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC4O15439 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC4O15439 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC4O15439 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC4O15439 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC4O15439 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC4O15439 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC4O15439 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC4O15439 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC4O15439 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC4O15439 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC4O15439 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC4O15439 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCC4O15439 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC4O15439 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC4O15439 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC4O15439 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC4O15439 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC4O15439 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC4O15439 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC4O15439 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC4O15439 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC4O15439 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC4O15439 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC4O15439 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC4O15439 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC4O15439 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC4O15439 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC4O15439 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC4O15439 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC4O15439 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC4O15439 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC4O15439 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC4O15439 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC4O15439 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC4O15439 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms