Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
APAF1O14727 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
APAF1O14727 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
APAF1O14727 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
APAF1O14727 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
APAF1O14727 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APAF1O14727 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APAF1O14727 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APAF1O14727 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
APAF1O14727 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APAF1O14727 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
APAF1O14727 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APAF1O14727 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APAF1O14727 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APAF1O14727 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APAF1O14727 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APAF1O14727 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APAF1O14727 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
APAF1O14727 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
APAF1O14727 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
APAF1O14727 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
APAF1O14727 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
APAF1O14727 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
APAF1O14727 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
APAF1O14727 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
APAF1O14727 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
APAF1O14727 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APAF1O14727 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APAF1O14727 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APAF1O14727 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APAF1O14727 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APAF1O14727 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APAF1O14727 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
APAF1O14727 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APAF1O14727 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APAF1O14727 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APAF1O14727 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APAF1O14727 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
APAF1O14727 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APAF1O14727 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APAF1O14727 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APAF1O14727 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APAF1O14727 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APAF1O14727 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APAF1O14727 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APAF1O14727 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APAF1O14727 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APAF1O14727 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APAF1O14727 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APAF1O14727 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APAF1O14727 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
APAF1O14727 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APAF1O14727 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APAF1O14727 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APAF1O14727 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APAF1O14727 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APAF1O14727 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APAF1O14727 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APAF1O14727 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APAF1O14727 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APAF1O14727 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APAF1O14727 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APAF1O14727 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APAF1O14727 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APAF1O14727 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APAF1O14727 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APAF1O14727 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APAF1O14727 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APAF1O14727 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APAF1O14727 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms