Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RGPD8O14715 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD8O14715 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD8O14715 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD8O14715 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD8O14715 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD8O14715 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD8O14715 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms