Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms