Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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